公共卫生框架中的基因检测 |
在世纪之交之前的几年中,遗传疾病的科学和医学关注主要集中在了解罕见的单基因疾病,例如亨廷顿氏病,杜兴氏肌营养不良症和囊性纤维化以及染色体异常。临床遗传医学专业于80年代和90年代在许多欧洲国家建立,以诊断这类罕见疾病并为患者和家庭提供咨询。近年来,基因组学和遗传学研究界已将注意力转向了理解常见复杂疾病的基础。常见疾病是医疗保健中经常遇到的疾病。一些常见疾病的特征是单个基因中种系突变的强烈影响。这些将被称为“单基因亚型”。在许多情况下,常见疾病的病因是多方面的:它们是由几种基因和环境因素引起的,涉及基因-基因或基因-环境的相互作用。关注靶向药物的肿瘤基因检测网将使用“复杂疾病”一词来指称具有多种病因的疾病,包括多因素病因和单基因亚群。当讨论本文中的“易感基因”时,关注靶向药物的肿瘤基因检测网指的是具有较低预测价值的遗传变异。但是,关注靶向药物的肿瘤基因检测网需要承认没有将预测值级别进行分类的公认阈值。如今,研究人员研究了人类基因组计划期间及之后发现的多种遗传多态性。全基因组关联研究的惊人增长1揭示了这些变异中的哪些代表常见疾病的危险因素。了解病因和病因,寻找预防和治疗这些疾病的新方法是主要挑战。研究中的特征或疾病包括冠状动脉疾病,心肌梗塞,中风,外周动脉疾病,肥胖症,1型糖尿病,2型糖尿病,乳腺癌,子宫颈癌,结肠直肠癌,前列腺癌,乳糜泻,双相情感障碍,克罗恩病,还有很多。如果有可能将这些研究结果纳入当前的临床和公共卫生实践,那么研究人员和从业人员必须为改变其日常工作的方式做好准备。
有关导致常见疾病风险适度增加的经常发生的DNA变异的信息的临床管理,需要采取与许多罕见的健康问题引起的遗传风险显着增加的方法不同的方法。研究结果转换为有用的医疗保健应用似乎滞后了。实施有用的研究结果可能需要数年或数十年的时间。同时,临床实用性非常有限的一些应用已经直接对消费者可用。如果遗传学和基因组学研究要履行其对改善诊断,治疗和预防的承诺,则需要理解和解决研究结果翻译的难题。遗传学研究界对遗传敏感性测试和筛查对改善医疗质量做出重大贡献的可能性表示怀疑。在卫生保健中实施被认为有用的基因检测应克服几个门槛。
广大民众的健康促进和疾病预防一直是公共卫生专业人员的领域;但是,到目前为止,公共卫生方法尚未考虑遗传风险因素,甚至通常都没有考虑家族病史。到目前为止,已经以一种万能的方式提出了有关生活方式,体育锻炼和营养的建议。基因组学时代展现了个性化预防和药物治疗的希望,许多人对此充满了热情,但其他人对此提出了质疑。鉴于研究的这些新进展,迫切需要从临床和社会角度评估常见疾病的基因检测和筛查的可能性及其影响。正如在罕见孟德尔疾病的基因检测,这些评估应该包括解析的有效性,临床有效性,临床应用和伦理,法律和社会问题,以及卫生经济方面。如果对常见疾病的基因检测在特定情况下具有足够高的临床效用,并且在医疗保健中实施可能具有价值,那么就必须确定其实施框架:临床遗传学,医学专家护理,初级保健,如基因筛选程序,或作为商业报价。目前,就常见疾病而言,单基因亚型的检测主要在医疗保健中进行。
在欧洲,需要在人类和临床遗传学家之间建立对这些发展的共识和看法,以使他们能够为欧洲联盟和成员国的未来决策提供依据。为此,在背景文件中收集了信息,作为2007年10月8日至10日在塞维利亚举行的一次专家研讨会的信息,该研讨会的主题是“常见疾病的遗传敏感性测试的临床有效性和实用性”。为了反映研究领域从罕见的单基因疾病向具有遗传成分的常见疾病的转变,该文件是对旨在证明和统一欧洲基因检测服务的若干文件和倡议的后续行动。由于利益共享和专业知识互补,它是三个方面的合作计划:欧洲人类遗传学会的公共和专业政策委员会,EuroGentest以及前瞻性技术研究所。PPPC参与制定人类和临床遗传学的专业标准,并发布有关遗传服务的国家和欧洲政策的建议。EuroGentest是由欧盟资助的卓越网络,旨在实现基因检测服务的标准化和统一,并提高欧盟内部提供的遗传服务的整体质量。这包括建立程序和准则,以验证方法和技术,向医疗专业人员提供质量保证的信息源,以及适当利用遗传服务。IPTS是欧盟委员会联合研究中心的七个科学研究所之一。它为欧盟就社会经济,科学或技术层面的问题制定政策提供了依据。
在塞维利亚研讨会之后,为了使人们能够进一步讨论一些遗传流行病学问题,2008年9月在阿姆斯特丹组织了一次研讨会。根据会议和其他专家的意见,将背景文件修订为目前的形式,其中一些专家活跃于欧盟资助的欧洲公共卫生基因组网络,项目和在加拿大公共卫生局之下成立的国际GRAPH-Int联盟。建立这些组织的目的是在欧洲和全球范围内促进将基于基因组的知识和技术负责任和有效地转化为公共政策和公共卫生服务。建议已纳入背景文件中,PPPC在此过程中讨论了建议。2009年夏季,分发了背景文件和建议草案并发布在网上,以征询更多意见。在此程序之后,对草案进行了修订。PPPC和ESHG理事会批准了最终版本。最终文本有望反映出欧洲人类遗传学科学和专业界的观点。
在本文中,关注靶向药物的肿瘤基因检测网将从医疗保健的角度讨论基因检测和常见疾病。基因测试的新可能性使医护人员面临着要测试谁以及要使用哪种测试的问题。本文档重点介绍常见疾病的基因检测和筛查。术语“常见疾病”用于个别对公共卫生有重大影响的疾病。常见疾病的示例包括心血管疾病,中风,糖尿病,癌症,痴呆症和抑郁症。对于卫生保健从业者,可能尚不清楚常见疾病是由于具有严重疾病高风险的一个基因,还是由于多个基因和几种环境因素的结合。对于同时存在两种病因的疾病,病因可以被认为是“复杂的”。孟德尔病也可能具有复杂的病因:一个主要基因,许多修饰基因以及一系列环境因素。这不是本文档中“复杂”的意思。
目前,常见的复杂疾病被重新定义为一系列症状相似但病因却不同的疾病:一些基因,许多基因,基因之间的相互作用,许多环境因素等。“复杂”与“单基因或孟德尔”之间的主要区别是在孟德尔或单基因疾病中,一个基因的改变是通过该疾病发展阈值的先决条件,尽管在某些情况下,突变的影响可能受到其他基因的遗传变异或由遗传所引起的表观遗传事件的调节。环境,生活方式等因素,而在复杂的疾病中,是否会发展疾病和严重程度均受复杂的病因学影响。在孟德尔疾病中,由于一种基因,人们越过了疾病的门槛。在复杂的疾病中,需要不同的因素来超过阈值。BRCA1或BRCA2基因,其中携带突变会使个体接近阈值,但其他基因环境因素会使个体超过阈值,即导致疾病。孟德尔疾病可以作为常见复杂疾病的示例,以深入了解病因学途径和途径,以潜在地实施医疗保健中的特定计划。对于常见的复杂疾病,遗传学和基因组学研究有望使医学个性化。替代单一解决方案的方法,可以将疾病分为病因不同的亚组,这些亚组也根据预后以及对治疗和预防的反应而有所不同。从罕见的单基因疾病中吸取的教训可能有助于针对常见的复杂疾病进行医疗保健定制。
存在“遗传”,“筛选”和“测试”的不同定义。为了本文档的目的,关注靶向药物的肿瘤基因检测网将在广义上使用遗传“测试”,而关注靶向药物的肿瘤基因检测网使用遗传“筛选”为某些特定群体的成员提供系统,主动的服务。筛查可能是组织良好的公共卫生计划,通常针对低风险人群。“基因”测试将定义为对特定疾病或疾病组的一种或多种遗传危险因素进行评估的DNA或生物标记分析。在医疗保健中,必须将基因筛查与基因检测区分开来,因为背景和含义是不同的。传统上,基因测试是对出于某种原因主动寻求专业建议的患者或家属进行的。因此,在健康护理环境中,测试可以向健康专业人员提供用于诊断,预后,疾病管理进一步治疗个体患者的相关信息。有时也以更广泛,更全面的意义使用基因检测。基因测试可用于基因筛查程序。
传统上,基因筛查是指针对无症状人群的明确和系统的方案已知风险会增加或生活的特定阶段值得进行筛查的个体或亚群,例如孕妇或新生儿。区分不同类型的目标人群,此外,区分这种系统的方法和为无症状人员提供检测的情况。就像筛查一样,无症状者可能会使用直接面向消费者的基因检测方法。尽管可以出于娱乐目的选择这些测试,但它们可能会产生医学相关信息。商业基因测试或筛查可能针对多种疾病,但是,在某些情况下,同样在常规的医患关系中,可能会引入更系统的测试方法。当测试成为特定患者组的标准方案时就是这种情况。测试乳腺癌肿瘤组织中的突变提供了这种系统方法的一个很好的例子,因此可以将其视为基因筛选的一种形式。在本文中,关注靶向药物的肿瘤基因检测网将特别指出在提到筛查时隐含了哪些方面。
在基因筛查中,医疗机构或医生可能会向个人提供测试,这可能给公众留下这些测试是强加给人的印象。道德困境被放大了,医师的责任也相应地增加了。疾病的遗传性质可能会对被筛查人员的血亲产生风险,即使他们可能没有被包括在筛查计划中,也可能不希望被包括在内。在1968年为世界卫生组织制定了经典的筛查标准清单时,提供治疗的可能性被认为是提供声音筛查程序的必要前提。从那时起,对这些标准进行了许多改进,例如关于可治疗性。特别是在基因筛查的情况下,另一个目标可能是提供有关生殖选择的信息和选择,通过预防措施来降低风险。理想情况下,对常见的复杂疾病进行基因筛查将理想地提供与生活方式,药物治疗或干预措施有关的预防策略,例如定期监测。然而,基因筛查识别谁应该或不应该提供特殊生活方式建议或医疗干预的歧视性力量仍然存在争议,尤其是对于那些具有较低相对风险和较低预测价值的“易感基因”。
当使用“易感性”测试或筛选一词时,可能会暗示可能隐含的风险级别。不能在药敏测试与预测性或症状前测试之间进行明确区分。原则上,测试较高渗透性的基因,例如BRCA1或BRCA2,可以视为一种药敏试验,最值得注意的是,在美国,“药敏试验”一词也用于这些高渗透性药物。失调。然而,实际上,这些类型的信息性测试被认为是具有预测性的,与高渗透性单基因疾病和常见疾病的单基因亚型有关,而术语“药敏测试”是为与常见疾病相关的较低预测值保留的。本文回顾并讨论了有关常见疾病的基因检测和筛查的当前生物医学,流行病学,伦理学,社会科学,公共卫生,卫生经济和卫生技术评估文献,以及有关法规和政策问题的文献。
在《社会科学引文索引》中使用与遗传易感性相关的关键字以及对常见疾病的检测或筛查进行了搜索。此外,还从相关文章中选择了参考文献。尤其考虑了评论,报告,立场文件和社论。还使用了有关遗传敏感性测试的HTA报告。为此,对通过互联网可访问的几个数据库进行了调查,并对有关测试服务评估的相关文献进行了审查。鉴于一方面是由高渗透性基因型引起的罕见,通常是严重的单基因疾病的两极,另一方面是与低渗透性基因型相关的多基因,多因素常见疾病,本文着重于与高外显率或低外显率的基因型:尤其是那些需要考虑公共卫生影响的条件,即应提供哪种水平的临床效用测试以及如何在实践中进行实施。对于许多常见疾病,存在单基因亚型,包括某些形式的癌症。从卫生保健中学习有关单基因疾病和单基因亚型的知识可能有助于决定在卫生保健中实施或不实施的潜在途径。
本文档的局限性在于分子途径,群体遗传数据,检测表现以及社会,心理,伦理和健康经济数据以及关于药敏试验的经验的信息的缺乏或缺乏。此外,试点或推销测试的设置也在不断变化。“新技术很少以其最佳效力和最低成本充分形成。而是随着临床医生掌握新技术并对现有技术进行调整和修改以适应临床情况而发展起来,新技术的成本可能会随着开发成本的覆盖,吸收率的提高以及医疗服务提供者的重组而迅速下降。更有效地提供服务。所有这些都是在实施过程中相当大的一部分发生的。”因此,关注靶向药物的肿瘤基因检测网可以从该背景文件中获得的数据可能具有有限的价值。但是,科学发展迅速,全基因组关联研究正在迅速揭示常见疾病与遗传变异之间的关联,因此,只要合适,关注靶向药物的肿瘤基因检测网将使用与现有形式的检测和筛选类似的方法,包括对常见复杂疾病的单基因亚型进行检测和筛选。还将讨论诸如血色素沉着病和家族性高胆固醇血症等特殊情况。在各个国家和医疗中心为这些疾病提供的医疗保健不在临床遗传学的范围内,并且可以指导关注靶向药物的肿瘤基因检测网对常见复杂疾病的未来基因检测和筛查的思考。
该文件将不会考虑种系的产前或妊娠前测试,也不会考虑针对肿瘤复发的生物标志物测试,但将讨论对肿瘤组织中突变的测试,因为这可能表明对某些治疗方法的敏感性。而且,尽管将给出药物基因组学测试的一些例子,但是药物基因组学的应用将不会被深入讨论。在下一部分中,将介绍常见的复杂疾病的地形。讨论了用于基因测试和筛选的不同评估框架。接下来的部分将检查常见疾病的基因检测和筛选的目标和策略,并讨论欧洲当前检测和筛选的一些示例。“基因检测的经济评估”部分讨论了不同类型的检测和筛查策略的成本-收益关系,以及如何以成本有效的方式将其用于临床。下一节讨论了常见疾病的测试和筛查的道德,法律和社会问题。最后一部分讨论了欧盟和美国的法规和知识产权问题。
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