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基因检测
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基因测试在运动障碍中起什么作用
基因测试在运动障碍中起什么作用

  神经遗传学研究的步伐不断加快,导致发现了约1,000种单基因疾病。其中超过200个具有可用的基因测试。基因测试的结果用于排除或建立明确的诊断。分子检查的敏感性和特异性超过了其他辅助检查,例如神经成像。包括突变筛选在内的遗传分析不仅在研究环境中进行,而且在商业上也越来越多地用作诊断测试。在短短几年内,随着测试设施的广泛普及,基因测试产生了意想不到的大量遗传数据,显示出意想不到的临床和遗传异质性。
   毫不奇怪,基因检测在常规实践中的作用尚不确定。一方面包括社会伦理法律方面,另一方面包括遗传和技术问题。有一些通用规则可以应用,但是,对于某些遗传性疾病,必须考虑特定方面的问题。此外,在新开发技术时,有时可能难以准确解释测试结果。因此,肿瘤基因检测网选择回顾和讨论运动障碍领域的基因测试的当前状态,并强调要点。肿瘤基因检测网将介绍术语,并讨论遗传学的一般方面。由于新的分子技术和数据解释的困难,肿瘤基因检测网还将介绍近年来出现的各个方面。
   在1860年代,格雷戈尔·孟德尔研究植物的变异,观察到不同的遗传模式,这些遗传模式是常染色体显性遗传或常染色体隐性遗传。简言之,根据定义,如果对于性状只有两个表型是可能的,和杂合子显示出一个表型,所表达的等位基因是显性隐性之一。换句话说,在常染色体显性遗传情况下,一个突变的基因足以使疾病显示其手感。相反,在隐性疾病中,传统上需要两个缺陷的基因拷贝来引起该疾病。常染色体显性遗传的经典例子是亨廷顿舞蹈病。常染色体隐性遗传的一个例子是威尔逊氏病。
   然而,近年来,随着对疾病基因的鉴定不断发展,包括与帕金森氏病相关的基因,研究人员开始质疑已建立的传统孟德尔概念的简单适用性。例如,从大型研究中筛选出隐性遗传的帕金基因突变的经验表明,超过一半的患病患者仅携带一个突变的等位基因。对于隐性PINK1基因也有类似的报道。相反,由于年龄依赖性的外显率降低,大多数在主要传播的LRRK2基因中携带单个突变的患者由于临床原因不受影响。在帕金森氏症中进一步挑战使用孟德尔清晰的传播方式,已经描述了许多患者在纯合状态下在LRRK2中携带频繁的p.G2019S突变。但是,纯合子和杂合子之间没有可观察到的差异,因此反对基因剂量效应。也许不足为奇,已经报道了许多患者的一种以上已知PD基因发生突变。最后,在尝试确定PD的单基因形式及其遗传模式的可能性时,甚至需要考虑一个家族中从头突变和表型的发生。
   在许多情况下,某种基因型的存在并不一定会导致特定的表型,而是预示着发生这种情况的风险。术语“渗透性”反映了这种现象,指的是会出现症状或临床体征的突变携带者的比例。因此,尽管对于某些疾病而言,渗透率是完全的,这意味着基本上每个突变携带者最终都会发展该疾病,但是在其他条件下,渗透率会被轻度或显着降低。渗透率越低,“沉默地”将遗传改变传给下一代的未受影响的突变携带者的相对数量就越高。例如,HD的渗透率为100%。相反,已知在某些肌张力障碍中外显率降低。在咨询患者及其家人有关疾病风险的建议时,必须考虑这一点。
   环境因素和遗传因素都可能影响某些基因突变携带者是否表达该疾病,而另一些则不。遗传影响可能位于同一基因中,也影响突变的等位基因或影响健康的等位基因,位于致病基因附近,上游或下游,影响基因表达或定位在功能相关的其他基因中。一个示例是减轻DYT1影响的编码序列变化D216H。研究表明,具有GAG缺失的反式H等位基因具有高度保护作用,而顺式D216等位基因必须使该疾病具有渗透性。随着对这种分子机制的深入了解,遗传咨询变得更加复杂和具有挑战性,但也更加准确。在DYT1肌张力障碍的情况下,对健康父母进行D216H等位基因检测可能会提供有关患此病风险的儿童预后的其他信息。
   许多疾病具有表型变异性。因此,在那些表现出这种疾病的人中,有些人受到的影响要比其他人严重,而且临床情况可能会千差万别。除其他因素外,这归因于修饰子基因的存在与否和影响某些基因突变的某些遗传背景。在这种情况下,特定突变可能对某些遗传背景没有影响,但可能对其他遗传背景有严重影响。但是,由于主要基因和修饰子可能会或可能不会独立分离,因此家族风险评估可能会很困难。在聚谷氨酰胺疾病中,表型还受到重复长度的影响。该组的特征是三核苷酸重复扩增超过正常,稳定的阈值并引起疾病。例子包括HD,许多脊髓小脑共济失调和脆弱的X综合征。重复扩展的长度与关于发作年龄和表型的临床表现相关。中间重复长度可能与明显的表型有关。
   有广泛的临床和遗传异质性。临床异质性意味着疾病可能表现为各种临床表型。例如,在帕金森氏症的不同遗传类型中,表型的范围从模仿特发性PD的形式到临床症状复杂的综合征,其中帕金森氏症仅是几种临床特征之一,例如PARK9或PARK14相关疾病。甚至一个基因也可能出现不同的综合症。一个例子是FA2H基因的突变,可能带有“三张不同的面孔”。相反,遗传异质性意味着某种临床情况可能是由多个基因的突变引起的。例如,一些基因和突变已与临床上典型的PD相关,包括LRRK2突变和SNCA复制,以及隐性基因Parkin,PINK1和DJ-1的突变。另一个例子是PANK2和PLA2G6中的突变,这些突变会导致NBIA疾病,其特征是早发性锥体束外锥体束综合征。或一组类似HD的疾病,与许多不同的基因相关。这有时仅凭临床理由很难选择特定的基因检测。目录包括在线源可以提供关于特定综合征。
   必须强调的是,运动障碍学会的国际机构目前还没有针对运动障碍进行基因检测的正式指南。建议已经被提出了个体的疾病,如HD或由多学科重点群体或社会国际脆性X相关病症。基因测试的不同设置包括对症测试,症状前测试,植入前测试和药敏测试。对症测试旨在阐明当前状况的起源,而对症前测试则用于检测与以后发生的疾病相关的遗传改变。对症状明确的家族病史进行仔细选择的患者,如果他们在测试时没有症状,可以考虑进行症状前测试。但是,必须对学术好奇心与基因测试对受试者的实际益处进行权衡。植入前的遗传诊断定义为对植入前阶段的胚胎或卵母细胞进行遗传缺陷检测。根据《欧洲人权与生物医学公约》第12条,预测性测试只能出于健康或与健康相关的研究目的而进行,并应接受适当的咨询。国家组织制定了更精确的规定。
   与有症状和有症状的测试相反,敏感性测试用于测试将来出现体征的可能性更高。而不是对个人而言,药敏试验与更大的高风险人群更相关,并且产生的信息更加不明确。研究环境,但不在常规临床实践中。同样,关于偶然发现的争论也在研究基础上展开。
   已为潜在后代有严重孟德尔疾病,线粒体疾病或平衡染色体重排风险的夫妇开发了植入前遗传学诊断。植入前的测试是一个复杂的过程,可以选择没有致病突变或重复扩增的胚胎。这也可以无需测试的结果传达给的情况下,父母,他们不希望被告知他们是否是有风险的运营商进行。从历史上看,在鉴定基因之前以及因此可能对基因本身进行突变分析之前,通过连锁分析的方法提供了基因检测方法。这使得有必要从谱系的其他成员那里获取样本,其中一些成员可能不希望知道其基因状态,但是却觉得有义务为其他成员而参与。在注册之前,应仔细确定为什么要参加基因测试的动机。然而,尽管事实是,对于许多遗传性疾病,直接检测已成为可能,但这种检测的家族意义一定不能低估。一个例子可能是以下情况:一名临床上未受影响的个体,其父母健康,但祖父母受显性遗传的迟发性运动障碍影响,寻求遗传评估。从理论上讲,患这种疾病的风险为25%。在这种情况下,一项阳性测试将证明该亲本也携带了HD基因突变。另一个例子是接受基因测试的单卵双胞胎,其中结果同样会影响另一对双胞胎。
   on病毒疾病的特点是accumulation蛋白折叠错误。从血液制品或外科手术传播procedures病毒疾病的报道,是因为常规的去污和灭菌不足。为了排除血液和组织/器官的捐赠,建议进行检测,筛查方法目前正在开发中。然而,除了零星的变体,occur病毒疾病的家族形式也发生并且与PRNP基因突变有关。关于传播风险仅在多大程度上解释了克雅氏病或对于遗传形式仍然适用尚不确定,关于筛查前症状性PRNP突变携带者存在争议。无症状携带者进行手术时的健康护理环境。
   很少有研究系统地解决对运动障碍基因测试的态度。大多数经验来自于高清,其中40%至70%的高危人群表示对症状前检测感兴趣,然后才开始使用。同样,在通常由基因决定的早发性PD中,大多数将接受症状前检查。但是,有关实际接受测试的数据显示出的比率要比态度调查所建议的要低得多。实际上,有10%到20%的人接受了高清测试,因此,大多数有风险的人选择在实现其可用性后就不进行症状前测试。参加考试的最重要原因是计划生育。的载体地位知识批判影响有关生殖未来生活的决定。研究表明,如果他们携带突变,则70%的患者会决定不生育孩子,而57%的患者会选择进行产前检查。相反,人们认为缺乏有效的治疗方法,对歧视的恐惧,健康保险的潜在损失,测试的财务成本以及无法“撤消”知识是有风险的个人可能推迟测试的原因。
   最近对美国和亚洲人群中PD基因检测的知识和态度的比较显示,这些独立的,种族和文化不同的人群及其护理人员存在明显差异。尽管美国患者对PD遗传学的知识水平高于亚洲患者,但更多的美国PD患者和护理人员对基因检测的潜在医学益处持积极态度,但对基因检测的潜在医学优势却持消极态度在获得健康和人寿保险方面的潜在妥协。同样,来自高清的经验表明,决定接受测试的人们的教育水平高于一般人群,女性人数过多,这可能反映了他们传统上对生殖的更多参与。这些数据强烈表明,在潜在使用其他家庭成员,雇主,保险公司和政府机构通过DNA测试获得的信息时,需要进行科学教育和社会讨论。在一项针对因果性HD突变而获得阳性测试结果的受试者的研究中,有2%发生了灾难性事件。重要的是要注意,心理困扰不仅与考试结果有关,而且还与个人特征有关,包括心理史,考试动机,准备水平和社会支持。即使收到正常的测试结果也会引起情绪困扰。因此至关重要提供广泛的咨询和使用警惕评估风险个体时测试合格,确保心理健康。这应该被进行了使用已建立的方案,并通过一个多学科小组。
   遗传学是肿瘤基因检测网日常生活的一部分,远远超出了这里讨论的范围。它是在对食品和物品进行基因操纵的背景下公开讨论的,它在取证方面起作用,并且它具有在保险和就业政策的背景下成为重要问题。同时,已经做出努力来规范遗传技术和遗传信息的使用。关于后者,2008年美国《遗传信息非歧视法》取得了里程碑。立法限制了雇主,团体健康计划和健康保险公司对遗传信息的不当使用。也就是说,GINA禁止雇主在雇用,解雇,安置工作或晋升决定时使用遗传信息。同样,它会禁止保险选择偏见。因此,GINA保护患者,并总体上鼓励利用基因检测来预防和预防潜在疾病。同样,欧盟规定“反对工人进行任何形式的遗传选择是肿瘤基因检测网的基本立场”。这意味着基于对个体的易感性或易感性进行预测性评估的基因筛查在雇佣关系中必须被定为非法许多国家遵循类似的指导原则。不过,也有保险法的国家差异,一些国家已经制定了相关政策规模的保险公司异常。因此,特别是鉴于基因检测和保险公司国际市场日益商业化,而忽略了国界,法律制度的协调似乎是一项及时而紧迫的任务。
   考虑和订购基因测试并解释结果的过程并不简单。各种疾病的基因检测可能使用不同的方法,可能具有多种检测率,并且在各种情况下通常使用不同的方法。诊断测试应由符合现代技术标准的认证诊断实验室执行,进行全面测试,并以清晰及时的方式提供测试结果 。网站提供了不偏不倚的实验室清单,这些实验室提供了全球范围内的运动障碍基因检测。测试实验室应在测试前向提出要求的医师提供费用估算或报价,并提供逐步的方法。一些实验室与临床专家合作,后者帮助确定基因测试的优先级并解释个别病例的结果。如果首先对受临床影响的家庭成员进行检测,则基因检测将提供最多的信息。因此,重要的是要确定一个特定的基因检测在家庭中是否能提供有用的信息,然后再使用该检测来预测临床上未受影响的家庭成员的遗传状况并随机使用检测。
   尽管直接的技术问题很少用于DNA检测,但很少有结果研究报道在学术中心以外的地方检测敏感性,特异性和检测方法。必须考虑基因大小的变化,尽管一些基因很小,而另一些基因却很大,或者包含相当数量的外显子。此外,已经怀疑基因剂量的改变。对于某些疾病,可能足以测试常见突变,但是对于其他疾病,这当然并不全面或不适当G2019S突变。总体而言,突变分析是劳动密集型的,尽管价格正在缓慢下降,但测试仍然昂贵。下一代测序的问世将有助于进一步降低测序成本。对于诸如HD或某些小脑共济失调的多谷氨酰胺疾病,测试的技术方面相对简单;然而,关于正常与病理性重复大小的阈值之间存在着不断的争论。此外,对于某些基因,已经描述了中间范围,有时可能与不同的表型有关,并且可能存在性别差异,这可能会使咨询变得复杂。
   基因分型阵列,高通量筛选分析和运动障碍测序芯片包括已知的突变或已知的基因;然而,当鉴定出新的基因和突变时,它们不容易更新。值得注意的是,诸如阵列比较基因组杂交之类的最新技术也可以用于鉴定基因中的突变。重要的是,这种非选择的筛查可能会揭示与疾病相关的遗传异常,而不是关注的疾病。下一代测序无疑将彻底改变肿瘤基因检测网进行基因检测的技术方法。但是,尽管即使在今天还是可能的,并且其价格可能比测试与疾病相关的个体基因的变化便宜,但是对整个外显子组或基因组进行测序都不是“简单的”。解决方案,用于将来的基因测试。考虑到“不知道的权利”,大多数伦理委员会和国家法律将不允许在诊断环境中对患者的整个基因组进行未经选择的筛查。重要的是,无论使用哪种方法,阴性结果都不能完全排除突变,因为迄今为止任何可用方法的敏感性和特异性均低于100%。此外,阴性结果并不意味着该疾病不会发生。
   除了提供经典诊断测试的实验室外,近年来,提供低成本,直接面向消费者基因测试的公司也进入了这一领域。他们的目标是使特权科学信息大众化。两家公司争辩说,他们的服务是“教育性的”而不是“诊断性的”,在这种情况下,它们将受到更为严格的规定的约束。当前,很少有联邦法规来限制此类DTC测试。提供的服务范围从“健康观察扫描”到有关血统和相关性的测试。有趣的是,提供的检测与目前通过国家卫生服务提供的基因检测的清单几乎没有重叠。例如,23andMe的检测方法包括检测“携带者状态”和“疾病风险”。但是,如果没有疾病经验,则外行人员及其主治医生可能难以解释测试结果。这增加了公众对基因检测的不确定性。如上所述,在基因检测的法律规定方面存在国际差异。这也适用于DTC测试。
   遗传变异的鉴定越来越多,包括临床意义不确定的变异。平均而言,每个人在带注释的基因中携带大约250至300个功能丧失的变异体,以及先前与遗传性疾病有关的50至100个变异体。不同的种族背景增加了数据解释的难度。因此,“ 1,000个基因组计划”是一项重要的计划,旨在启发人们的遗传变异范围。作者使用外显子靶向测序研究了来自七个种群的697个个体,并提供了大约1500万个SNP,100万个短插入和缺失以及20,000个结构变异的位置,等位基因频率和局部单倍型结构,其中大多数以前没有描述过。这是不足为奇的遗传结果的这种解释因此可以挑战。使问题进一步复杂化的是上述的外显率降低,疾病表达能力可变以及“隐性”基因中杂合突变不确定性的问题。迄今尚未发现的基因的存在以及已经鉴定出的基因中突变范围的图片仍不完整,进一步增加了复杂性。
   因此,建议在包括遗传临床医生在内的多学科团队的背景下进行测试,以便客户有机会充分讨论并权衡测试的所有可能好处和局限性,从而做出真正明智的决定。在进行基因检测之前,患者需要意识到不能提供个人的确切预后。此外,由于缺乏任何经过验证的神经保护和“基因特异性”治疗方法,对运动障碍的阳性识别,遗传形式的诊断尚未导致任何不同的治疗症状管理。例外情况包括多巴反应性肌张力障碍,其中患者对左旋多巴治疗表现出良好而持续的反应。但是,在DRD中,诊断通常是在临床上进行的,通常在阳性左旋多巴试验后而不是在其之前进行基因检测。
   基因测试及其相关问题很复杂。需要清晰的基础设施,工具,资源,指导方针和程序来构建结构,并在分子,细胞遗传学,生化和临床水平上更加协调和提高遗传服务的整体质量。肿瘤基因检测网将鼓励制定既定的运动障碍基因检测指南,包括罕见运动障碍。但是,在目前尚无基因分析的情况下,不应轻易进行基因分析,并且需要伴随测试前和测试后的咨询。与在高清中获得的通常信息量高的结果不同,在神经退行性疾病的基因检测中,HD是历史上的先行者,而对其他疾病的基因检测的结果通常是不确定的。
   在对每个个案进行仔细考虑之后,可建议在阳性家族史或近亲血统知识存在的情况下进行基因检测。此外,当通常发病较晚的疾病出现在生命的早期或存在非典型特征时,可能会有用。可以对某些个体进行症状前检查;但是,应该大力强调显性突变的外显率降低和隐性遗传基因中杂合突变的未知的临床意义,并且不建议使用基因检测代替现成的“疾病状态生物标记”。测试必须包括广泛的测试前和测试后咨询。在某些情况下,基因检测可以最大程度地减少后续检查,阐明治疗方法并协助将来的计划生育。随着神经预防,神经保护和神经修复的未来发展以及基因特异性治疗策略成为全球范围内大量研究工作的对象,对有症状和无症状运动障碍基因突变携带者的识别变得非常重要。实用性的重要性,并将深刻改变肿瘤基因检测网目前对基因测试的实用性的看法。

 
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