【佳学基因检测】GWAS科研外包服务基因检测:遗传相关性分析
佳学基因GWAS科研外包服务中的遗传相关性分析:
佳学基因采用LDhub或者是本地搭建的LDSC计算鸦片滥用与935种其他性状或疾病之间的遗传相关性(rg)(852种来自LDHub,83种来自自建数据库)[25]。根据先前已知的鸦片使用相关疾病和其他毒品使用障碍表型之间的表型关联以及LDhub上不可用的相关性状(例如,大麻使用障碍、各种形式的冲动性)选择本地性状。佳学基因使用标准Benjamini–Hochberg错误发现率校正(FDR 5%)对多次测试进行校正。计算了935次比较的Bonferroni校正(p < 5.35E−05); 通过修正参数,区分多种高度相关的特性特点。因为935个性状中的许多性状彼此高度相关。