【佳学基因检测】产前诊断中超声检查正常胎儿的CMA基因检测
与传统的细胞遗传学和FISH技术相比,使用CMA进行染色体异常的产前遗传学诊断的贼大优势在于CMA能够检测到更小的失衡。通过G显带进行的典型核型分析可能能够检测出大小为5-10 Mb的缺失和重复。然而,考虑到从一次产前检测准备到下一次产前检测的显带分辨率差异,10-20 Mb及以上是常规核型分析更现实的检测阈值。微缺失/重复综合征的标准FISH通常针对100-200kb范围内的失衡,但需要临床特征来指导探针选择,这对于产前样本来说是一项具有挑战性的任务。可以采用多重FISH探针,但可同时用于检测多种疾病的具有特定光谱独特荧光标记探针的数量有限,仅限于少数。为了提高诊断率,可以对许多FISH探针以次检测,但这样做效率低、耗时且非常昂贵。CMA可以在单个测试中检测基因组中任何地方的亚微观失衡(<5 Mb),其分辨率仅受芯片上存在的探针的限制。与核型相比,CMA在识别产前标本中常见的非整倍体方面的正确率为100%。在NICHD研究中,它证明了在晚期产妇、父母焦虑和阳性血清筛查患者中,诊断率比标准核型1.7%。贼近一项荟萃分析评估了10项大型研究中的10614个胎儿的CMA,在AMA和父母焦虑症患者中,有临床意义的CNV为0.84%(1:119)。
贼近的一项荟萃分析评估了CMA诊断的基因组疾病的发病率/外显率。来自8项大型研究的10314名胎儿显示,与早发综合征相关的CNV发生在1:270(0.37%)的妊娠中。约1:909(0.11%)的病例涉及晚发性疾病,1:333(0.3%)的病例观察到CNV易感性。通过将致病性CNV的个体风险与细胞遗传学可见染色体畸变的个体风险相加,Srebniak及其同事表明,总体而言,孕妇发生临床显著细胞遗传学畸变的风险高于1:180。此外,36岁以下的孕妇具有致病性CNV的风险高于唐氏综合征。
在通过超声探测没有发现异常的胎儿中,采用CMA基因检测检出的阳性率与核型分析的检出率相比,在不同的研究中呈现出相当大的变异性。早期的一项大型系统评价显示,CMA基因检测有1%的病例具有临床上意义的检测结果,而单项研究中,这一比例低至0.4%,另一项研究检出率高达2.0%。这种差异可能是由于使用的阵列平台、使用的阵列分辨率以及每个临床实验室报告实践的差异。当然,特定结果致病性的因实验室而异,而这些定义也随着时间的推移而变化。随着新的知识和公共数据库中共享结果的增加,与疾病在确定性关系的基因组区域数量增加,显著性不确定的变异(VUS)的发生率随着时间的推移而降低。例如,贼初的NICHD研究报告,致病性CNV和VUS的发生率分别为0.9%和2.5%。根据新的文献和公共数据库,每年对同一数据集的审评,使得致病性病例增加到1.8%,而意义未明(VUS)病例减少到0.9%。
(责任编辑:佳学基因)