【基因检测基因解码案例】囊性纤维化综合症——佳学基因
病情描述：
2018年4月，患儿男，10岁，主因'咳嗽、咳痰5年'于2018年4月收住入院。患儿5年前开始出现咳嗽、咳痰，为黄色黏痰，间伴发热，给予广谱抗生素治疗症状缓解，但短期内再次反复。3年前外院考虑结核感染，口服异烟肼、利福平及吡嗪酰胺治疗2年，病情仍反复，并逐渐出现活动后气促，外院鼻窦CT提示双侧上颌窦、筛窦炎症。胸部CT示双肺广泛混合型支气管扩张，肺气肿及肺动脉高压。患儿自起病以来，食纳可，易腹泻，大便常见油脂样物附着，尤以进食油腻食物后明显。既往1岁时有铅中毒及肠道手术病史，自幼汗多，汗渍明显，生长发育落后于同龄儿，智力发育正常。父母体健，有1兄，体健。
常规临床检查发现病情
体格检查：体温36.5 ℃，心率100次/min，呼吸27次/min，血压96/64 mmHg(1 mmHg＝0.133 kPa)，体重18 kg。身材矮小，营养不良，意识清楚。无皮疹，颈部触及数个黄豆大小可活动淋巴结，质中。咽(－)，双肺呼吸音粗，可闻及少许粗湿啰音。心(－)。腹平坦，腹壁静脉曲张显露，右下腹可见两个手术瘢痕，无压痛、反跳痛。肝肋下4 cm，质中，边锐，无触痛，脾肋下1 cm，质软，边锐，无触痛。肠鸣音正常，双侧睾丸未有效降入阴囊。脊柱四肢活动自如，无畸形，可见杵状指(趾)，下肢无浮肿。四肢肌力、肌张力无异常，克、布氏征阴性，双侧巴氏征(－)。
进一步检查：血常规、C反应蛋白及ESR正常；大便常规见脂肪颗粒；肝功能不同程度升高：丙氨酸氨基转移酶71.8 U/L，天冬氨酸氨基转移酶118.0 U/L，总胆汁酸205.5 μmol/L，碱性磷酸酶394 U/L，r－谷氨酰转肽酶169 U/L，其余未见异常；血脂降低：胆固醇2.3 mmol/L，高密度脂蛋白0.44 mmol/L，低密度脂蛋白1.21 mmol/L；免疫球蛋白IgG、IgA、IgM、IgE未见异常，类风湿因子(－)，T/B细胞亚群未见异常，抗核抗体、抗双链DNA、抗Sm抗体均阴性、血糖、微量元素及凝血功能未见异常，乙型及丙性肝炎抗体(－)，梅毒及HIV检测(－)；多次痰及肺泡灌洗液培养为铜绿假单胞菌，余病原学检查无阳性发现，心脏彩超正常，腹部B超示肝脏弥漫性纤维化。进一步腹部增强CT提示怀疑肝间质纤维化，肝硬化、脾大、门脉高压、侧支形成；门静脉肝内分支变细；胰腺显示欠佳。住院期间多次行支气管镜检见鼻咽部大量黄白色脓性分泌物，鼻窦口可吸出大量黄白色黏性分泌物，气管、左右主支气管及各叶段支气管管腔内均可见大量黄白色脓性分泌物。完善囊性纤维化跨膜传导调节蛋白(CFTR)基因检测，发现患儿CFTR基因c.648G存在纯合突变(图12)，并检测患儿父母CFTR基因，均为c.648G>A的杂合子(图13)。考虑患儿诊断为囊性纤维化(cystic fibrosis，CF)。
基因检测未查出病因
在某基因检测公司囊性纤维化全套基因检测没有发现基因变化。经医生推荐选择佳学基因致病基因鉴定基因解码。
基因解码找致病基因
佳学基因取患儿3ml抗凝静脉血，采用致病基因鉴定基因解码技术发现患儿CFTR基因c.648G存在纯合突变，并检测患儿父母CFTR基因，均为c.648G>A的杂合子。该突变在千人数据库、dbSNP数据库、ESP6500基因数据库均未记载。
二胎健康宝贝基因解码
患儿所含有的两个突变基因，一个来自母亲，一个来自父亲。因此，患儿父母继续采用自然受孕生育二胎，可能再次孕育病孩。需采用健康宝贝基因解码生育二胎。
为什么基因检测未查出病因？
导致该患者罹患疾病的基因突变位点不存在于任何国际、国内数据库中，包括千人数据库、dbSNP数据库、ESP6500基因数据库等数据库均不包含此位点。根据国际数据库设计的基因检测和采用数据库比对方法所进行的基因解读分析无法找到并明确患者的致病基因。需要采用致病基因鉴定基因解码的方法解读独特基因序列的病理影响才能找到致病基因。
囊性纤维化延伸介绍
囊性纤维化是常染色体隐形遗传病，发病率达1/2 000，致病基因携带率达1/22。国内报道的囊性纤维化病例多数具有典型的呼吸道症状，本例病例除具有典型呼吸系统表现外，同时消化系统的临床表现也比较明显。本病多因CFTR基因突变引起，CFTR基因编码的蛋白在氯化物和水分子跨上皮细胞转运过程中具有重要作用。CFTR功能异常时，氯离子不能正常排出，继而钠离子和水分子的输出受到影响，导致细胞外缺少水分，黏液堆积，在一些器官的腔道中形成栓塞。临床以慢性肺部病变、胰腺外分泌功能不全和汗液电解质增多为特征。由于CFTR蛋白通道广泛存在于呼吸系统、消化系统、生殖系统中，因此囊性纤维化是一种累及全身的系统性疾病，临床表现多样，呼吸系统受累时，出现咳嗽咳痰及鼻窦炎等症状。呼吸功能受损是囊性纤维化患者贼主要的致残和致死原因。黏稠分泌物堵塞支气管继发感染，反复细菌感染及异常免疫应答导致肺功能破坏，进一步加重了感染，形成恶性循环。囊性纤维化肺部感染早期贼常见的细菌是金黄色葡萄球菌，后期则以铜绿假单胞菌为主。铜绿假单胞菌能够产生生物被膜，增加了其在囊性纤维化中的致病性。慢性假铜绿单胞菌定植和肺功能恶化之间有强烈的关联性，尤其是幼年确诊的患者中。在本例报道中患儿多次痰培养及肺泡灌洗液培养结果均为铜绿假单胞菌，即使在使用大环内酯类抗生素破膜及强有力的抗生素治疗后，培养仍为阳性。
基因解码指导正确治疗
先后给予头孢哌酮/舒巴坦、美罗培南及环丙沙星抗感染，红霉素抗炎及破生物膜，氨溴索稀释痰液，补充维生素A、D、E、K，7%高渗盐水雾化稀释痰液及妥布霉素雾化治疗等，患儿病情好转出院。出院后一直给予高渗盐水及妥布霉素雾化治疗，口服阿奇霉素抗炎，继续补充脂溶性维生素，出院2个月后随访，患儿一般情况明显好转，几乎无咳嗽咳痰，无发热，无明显咳嗽咳痰，体重略有增加，复查纤维支气管镜仍可见大量脓性分泌物。
致病基因鉴定可分析的疾病种类
佳学基因致病基因鉴定基因解码可以分析发现三万多种疾病发生的基因原因。联系电话4001601189。佳学基因官网：http://www.jiaxuejiyin.com。以下为佳学基因检测分析的疾病种类的少量举例：
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(责任编辑：佳学基因)
