随着基因检测技术的进步同样带动了基因检测行业的百花争鸣,基因芯片已经成为较为常见的基因检测技术手段,在这里和大家简单介绍目前国际常用的几种基因芯片。
一、Illumina的SNP芯片
Illumina公司是著名的生物芯片及基因测序公司,其的基于微珠的BeadArray生物芯片,在高通量SNP检测市场上有着巨大的优势。著名的美国公司“23 and Me”就是用Illumina的Human Omni Express芯片做基因检测的。
Illumina的生物芯片系统主要由:芯片、扫描仪、分析软件组成。
(1)目前主要的扫描仪有HiScan和iScan两款。另外,NextSeq 550型(测序仪)也可以扫描部分类型的芯片。
(2)其的分析软件,主要是:Genome Studio。
(3)Illumina的SNP生物芯片的优势在于:
1、检测通量很大,一次可以检测几十万到几百万个SNP位点;
2、检测正确性很高,它的正确性可以达到99.9%以上;
3、检测的费用性价比相对较高。
二、Affymetrix 芯片
Affymetrix公司是著名的生物芯片公司,它的芯片当中包含了:RNA表达量分析(表达谱芯片)、SNP检测(基因分型)、拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV)、small RNA、甲基化等多种芯片。
应用得贼广的是表达谱芯片和SNP分型芯片两种芯片。
目前在售的仪器Affymetrix 的(生物芯片的)仪器主要有4个机型,分别为:GeneAtlas、GeneChipScanner 3000 7G(简称:7G)、GeneChipSystem 3000 DX2(简称:DX2)以及GeneTitan;
(1)GeneAtlas :是一个小型系统,它主要可以扫描4张芯片一组的小芯片条。特点是:经济、易用;
(2)GeneChip Scanner 3000 7G(简称:7G):与下面的GeneChipSystem 3000 DX2(简称:DX2)是同一款机器的不同版本,“7G”主要为科研版本;
(3)GeneChipSystem 3000 DX2(简称:DX2):是临床版本,取得了美国FDA和中国CFDA的认证。
(4)GeneTitan 是新机型,它的通量更大,自动化程度更高。相对检测成本会更低一些。
Affymetrix公司官方网站:www.affymetrix.com
三、Agilent的生物芯片
Agilent公司(安捷伦公司)的生物芯片和别的公司的生物芯片同样由:扫描仪、生物芯片、分析软件,三部分组成。
Agilent的生物芯片的主要特点为:
(1)生产的灵活性较高,方便客户定制化芯片,甚至可以接受少到“1张”芯片的定制化订单。
(2)其芯片扫描仪:SureScan DX,取得了欧洲的CE认证,和中国的CFDA认证。
目前Agilent生产的芯片,根据点阵密度的不同,分成密度较低的HD芯片(一张芯片上贼多可以有24万4千个点)和高密度的G3芯片(一张芯片上贼多可以有1百万个点)。
另外,Agilent的CGH生物芯片,在细胞遗传学中有着很广泛的接受度,其表达谱芯片,检测灵敏度高、检测速度快、检测的线性范围大,也很受欢迎。
Agilent公司官方网站:www.agilent.com.cn
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