尽管基因信息在疾病的发生、演变、及治疗中的作用各不相同,但是由于基因对人体的控制作用,基因信息在疾病、诊断与治疗中应用的正确度、可信度将直接影响医学从业人员的水平。
基因信息在疾病诊断的应用以三种产品形式出现:基因测序、基因检测和基因解码。
基因测序从本质上只是一种获取基因序列的技术,其产品与表现形式为PCR检测、一代测序、二代测序、芯片检测,产生的结果为基因分型结果。项目名称常常为全基因测序、全外显子检测、芯片检测、医学全外显子检测。但是由于基因序列本身并没有诊断和临床应用价值,以基因测序为本质内容的检测常常忽略了测序范围选择的合理性与全面性、分型结果与临床意义的匹配程度。基因测序常常用来进行科研服务。
目前临床上常常采用基因检测。基因检测的特点是根据临床的需要或者是医生的假设对患者的特定序列、特定位点的存在情况进行检测,并将检测结果与假设情形进行验证,从而帮助临床诊断与治疗。但是基因检测在逻辑上、设计上及疾病发生的客观实际上都存在着严重的缺陷。
我们之所以选择检测某个位点,是因为在过去的临床研究、科学实验研究中,发现某一个位点在某个病人身上出现,于是我们去检测我们面前的这个患者是否具有同样的突变。首先即使是患同样疾病的不同患者,进入临床研究的数量是极为有限的。其次,并不是每一个测过基因序列、找到过位点的都会进入数据库,其三,也是更为重要的一点是我们的病人是一个独特的个体,他的基因序列是沿着血缘关系传递下来的,有超过95%的可能是导致这个患者产生疾病的基因突变没有被研究过、没有进入数据库。因此,用已经报道的基因突序列来检测我们临床上的病人十有八九的结果是阴性结果。根据已经发表的序列设计开展基因检测从逻辑上和实践上都有缺陷。
一般的基因检测机构即使是进行全部基因序列测定,由于在分析变异序列时采用的是数据库比对策略,也不能满足诊断和治疗的要求。
由于纳入研究的病人数量有限,而且全基因测序、全外显子测序技术并没有用在每一个患者的检测分析上,很多导致一个疾病发生的突变并没有被检测出来,进入数据库的病例也只是少量的病例。而每一个基因都会有数百万个突变的可能,这些突变可能绝大多数没有被列入目前世界上任何一个数据库里,因此目前采用数据库比对的方法进行基因检测即使是进行了全基因测序、全外显子测序也无法对罹患基因病的患者找到病因,产生了大量意义未明的检测结果。
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