【佳学基因检测】PrediXcan 在表型与基因型研究中的应用
为了让科研服务合作伙伴应用先进的生物信息学基础,佳学基因介绍了通过QTL数据集(如GTEx, 在介绍时,佳学基因交替使用QTL和GTE,尽管这些分析方法可以在任何转录组学研究中使用)对GWAS变异序列进行协调使用和注释的方法。
在全基因组关联分析研究中(GWAS),存大着大量的、各异的数据信息,这些研究的特点是使用的平台不同,注释的方式不同,调用的参照基因组也互不相同。
佳学基因对PrediXcan系列分析方法时行了深入分析,并将其移植到新一代全基因组关联分析研究中,以建立转录本和人体表征的关联性。当变异位点和分析模型数量有限时,分析的效果在每一个转录组范围内的分析方法中从总体上会降低。
这说明,在一个特定的GWAS分析中,参与分析基因位点可能与转录组分析模型不能很好地进行匹配,所以预测效果降低。佳学基因认为,在任何一种应用中,都需要考虑GWAS模型中的基因位点的变量交叉分析方式。
(责任编辑:佳学基因)