【佳学基因检测】SAMD9基因检测
SAMD9的功能：
SAMD9是一个与SAMD9L同源的高度保守基因，与它的同源基因具有共同的基因结构，两个基因编码的蛋白质具有58%的氨基酸同源性。大多数哺乳动物都有Samd9和Samd9l。然而，小鼠只有Samd9l，而奶牛只编码Samd9，这表明这些基因部分互补了彼此的功能。SAMD9和SAMD9L一样，参与控制细胞增殖，并在某些癌症中起到肿瘤抑制作用。已知SAMD9基因的有害突变可导致正常血球型家族性肿瘤性钙沉积（NFTC），这是一种罕见的常染色体隐性疾病。NFTC的特征是皮肤和牙龈的异常炎症，这是由干扰素途径的过度信号引起的。与此一致，SAMD9的功能受到干扰素-γ的严格调节。
SAMD9突变导致海市蜃楼综合征
贼近的研究已经在患有脊髓发育不良、感染、生长受限、肾上腺发育不良、生殖器表型和肠病的儿童中发现SAMD9突变，命名为幻影综合征（OMIM#617053）。在贼初的报告中，大多数受影响的儿童在儿童早期死亡，但两名寿命延长的个体出现了单体7型MDS，导致突变SAMD9等位基因丢失。贼近的一项研究还报告说，在7名有亲代DNA的幻影儿童中，突变是从头发生的，位于高度保守的残基中，通常影响精氨酸（8个中的6个），一半的突变聚集在SAMD9的982和983密码子热点。因此，结论是，海市蜃楼综合征背后的SAMD9突变是GOF，对细胞生长的负面影响给细胞带来选择压力，使其失去突变拷贝。此外，这表明这些基因同源物的功能非常相似。然而，除了相似的血液学表型外，尚不清楚为什么SAMD9L突变导致小脑萎缩，而SAMD9突变与复杂的多器官缺陷相关。我们假设SAMD9相关疾病中可能的神经表现可能一直未被注意到，因为大多数患者在神经系统尚不成熟且轻度平衡问题或视觉问题不明显的情况下，在很小的年龄就死亡了。
Buonocore等人描述了八名幻影患者，其中六名儿童患有宫内生长受限和严重睾丸功能障碍，导致女性外生殖器，而其余两名儿童患有非典型外生殖器（图。1b及和2）2）[28]。迄今确认的19例新发幻影患者中，大多数在病史中有骨髓衰竭（各种细胞减少）和感染的迹象。总共有四名儿童的寿命更长，并出现了7号染色体畸变的MDS。引人注目的是，在进行细胞遗传学检查的三名非MDS患者中，造血细胞显示了7号染色体的某种形式的畸变，即单体7或7q-。这三名患者的初始VAF约为50%，但在随后的样本中显示出较低的VAF，这表明由于单体7或7q-而失去GOF SAMD9突变的克隆的扩增。这些患者没有发生MDS的原因可能与时间有关，因为他们都在5-21个月大时死亡。与ATXPC中GOF SAMD9L突变的观察结果类似，GOF SAMD9突变也被其他遗传机制逆转，如幻影综合征患者（包括非显性造血表型患者）血液中的移码或停止增益突变（图3）。
遗传性SAMD9突变导致轻度表型
Schwartz等人贼近发现了一个具有遗传性SAMD9突变的家族，其中三名儿童在早期发展为单体7型MDS。虽然母亲有效不受MDS和遗传逆转的影响，但所有三个孩子都通过不同的机制在血液中表现出克隆性体细胞逆转。一名受影响的儿童有7号染色体的CN-LOH和同时发生的单体7，而另外两名儿童有单体7以及SAMD9的顺式突变，主张通过这两种机制中和生殖系GOF变体。
只能推测，新发和家族性SAMD9突变之间的差异在于GOF的严重程度。较弱的GOF变异可能是可耐受的，而较严重的GOF变异只能因胚胎致死性而从头发生，或因伴随的生殖器畸形导致不育而无法在人群中固定。然而，在报告的家族中，尚不清楚为什么母亲没有表现出任何表型，也没有表现出任何遗传逆转。不幸的是，RNA不能用于检测SAMD9的单等位基因或双等位基因表达。
