基因解码,变革肿瘤诊断与治疗
根据癌症起源确定肿瘤的分类
一直以来,肿瘤的位置是我们确定治疗方案的主要方法。而基因解码对33种癌症、11286份肿瘤样本的染色体非整倍性、DNA甲基化、mRNA、miRNA和蛋白质数据进行了整合分析发现,解剖学上的33种癌症重新归类为28种亚型。针对某一种分子亚型,其中竟能包括传统解剖学意义上的25种癌症而这项研究对我们了解不同肿瘤类型之间的关系是有帮助的。肿瘤的基因多样性,使我们重新思考对待它们的方式。在癌症的发展过程中,癌细胞的形成和分化程序、原始细胞的表观遗传状态、病原体和炎症等致突变因素,都会影响癌细胞的基因组,我们认为的同一种癌症,在分子水平上具有很大的差异。基因解码发现按照解剖位置分类的同一种肿瘤中,仅有1/3的的肿瘤表现了同质性,而其余2/3均有不同程度的异质性。
按照解剖位置对肿瘤进行分类,同种癌症有不同的分子特征,不同种癌症却具有同样的分子特征,而肿瘤的分子特征更能揭示肿瘤发生、演变的内大规律,这表明肿瘤的诊断治疗方式应当现变革。以分子特征作为基准,至少将会有1/10癌症患者需要重新分类,可能需要新的治疗方案。
基因解码变革癌变过程的认识
基因解码揭示了父母遗传给自己的肿瘤基因和自己在生长发育过程中产生的基因突变在癌症进展中的作用,论述了突变对细胞信号传导和免疫细胞组成的影响。研究者们从肿瘤发生过程中三个方面进行了解码,包括:(1)体细胞与生殖细胞突变在肿瘤发生中的相互作用;(2)肿瘤基因组和表观遗传组对转录组和蛋白质组的影响;(3)肿瘤与微环境之间的关系。研究者将大量数据进行了整合,阐明了复杂的致癌过程。在半个世纪的“癌症之战”中,DNA测序后的基因解码给预防和治疗带来了新的希望,靶向抑癌因子突变、融合蛋白、免疫应答等新型疗法逐渐走进视野。生物医学研究正逐渐离开对肿瘤的单一评估,多组学将成为科研的主流。
在本部分的其余12篇论文中,研究者们详细论述了癌症相关的数百种生殖细胞突变、融合基因、免疫组化模式、淋巴细胞浸润模式、增强子活性、染色体非整倍体、长链非编码RNA(IncRNA)、剪切突变等分子特征与癌症发展的关系。
这些复杂的相互作用过程表明,我们应当在更广阔的视野下评估癌症,这将导致临床和科研的巨大变化。
(责任编辑:佳学基因)