【佳学基因检测】斜视基因检测排除非遗传性斜视
非遗传性斜视与遗传性斜视
斜视（Strabismus）是指眼睛的对准不正常，使得双眼无法同时注视同一目标。斜视可以分为非遗传性（或环境性）斜视和遗传性斜视。以下是这两种类型的斜视的详细比较：
非遗传性斜视
1. 定义与原因：
- 定义：非遗传性斜视是指由于环境因素、疾病或外部因素引起的斜视，并不直接由遗传因素造成。
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原因：常见的原因包括：
- 眼外肌麻痹：如由于脑卒中、外伤或眼部手术引起的眼外肌功能失常。
- 屈光不正：如远视或近视，如果未得到矫正，可能导致眼睛的调节失衡，导致斜视。
- 眼部疾病：如眼睛感染、炎症或肿瘤。
- 神经系统疾病：如某些神经系统疾病影响眼部肌肉的控制。
- 全身疾病：如甲亢、糖尿病或其他系统性疾病可能影响眼部肌肉的功能。
2. 临床特征：
- 非遗传性斜视通常可以在出生后较晚时期出现，可能与上述因素相关联。
- 斜视可能是单眼或双眼，也可以是间歇性的或持续性的。
3. 诊断与治疗：
- 诊断：通过眼科检查、视力测试、屈光检查以及必要的影像学检查进行诊断。
- 治疗：治疗可能包括眼镜矫正、眼部肌肉锻炼、药物治疗或手术治疗，具体取决于病因。
遗传性斜视
1. 定义与原因：
- 定义：遗传性斜视是指由遗传因素引起的斜视，通常具有家族聚集性，可能在出生时就存在或在儿童早期出现。
- 原因：常见的遗传因素包括：
2. 临床特征：
- 遗传性斜视通常在出生后不久即显现，可能涉及单眼或双眼，并且有家族史。
- 可能表现为内斜视（眼睛向内偏斜）或外斜视（眼睛向外偏斜）。
3. 诊断与治疗：
- 诊断：需要进行详细的家族史评估、眼科检查和可能的遗传学评估，以确定斜视的遗传因素。
- 治疗：治疗方法可能包括眼镜矫正、视力训练、眼部肌肉手术以及遗传咨询。遗传性斜视的治疗可能需要长期管理，特别是当斜视与其他遗传综合症相关联时。
斜视基因检测导读
非遗传性斜视与遗传性斜视的主要区别在于病因：非遗传性斜视主要由环境因素或后天疾病引起，而遗传性斜视则与遗传因素有关。准确的诊断和个性化的治疗方案对每种类型的斜视都至关重要，以确保最佳的视力和眼部功能。
斜视发生的基因原因
斜视（Strabismus）指的是眼睛的异常对齐，导致中央双眼视觉的丧失。共存斜视（Concomitant strabismus）是指在所有注视位置中，偏斜角度保持恒定，这种情况通常在儿童早期表现出来，被认为是视觉系统的神经发育障碍。因此，它作为一种复杂的遗传性特征遗传，影响2-4%的人群。采用自我申诉出现斜视的人群进行斜视发生的基因原因的解码，斜视发生的基因原因分析（1345例病例和65,349例对照）的全基因组关联研究（GWAS）发现了一个在染色体17q25上的单一全基因组显著位点。约20个变异位点位于NPLOC4–TSPAN10–PDE6G基因簇中，且几乎完全处于连锁不平衡（LD）状态，与斜视的关联最为显著（主要变异位点：rs75078292，OR = 1.26，p = 2.24E−08）。与加性模型相比，隐性模型对数据的拟合更好。与斜视的关联不受屈光不正的影响，在调整弱视后，斜视的关联程度仅有轻微减弱。该与斜视的关联在一个独立的临床诊断7岁儿童队列中得到了重复验证（116例病例和5084例对照；OR = 1.85，p = 0.009）。相关的变异包括2个强候选致病变异，预测具有功能性效应：rs6420484，它在TSPAN10基因中将一个保守的半胱氨酸（C177Y）替换为酪氨酸，以及一个4个碱基对的缺失变异rs397693108，预测会导致TSPAN10中的移码突变。该位点的群体归因风险约为8.4%，表明其在斜视易感性方面发挥了重要作用。
值得注意的是，斜视位点的主要变异位点 rs75078292 与非同义变异位点 rs6420484 具有非常紧密的连锁不平衡（LD，r2 = 0.98），后者在TSPAN10基因的177位点将一个进化上保守的半胱氨酸替换为酪氨酸（C177Y）。考虑到其CADD评分为16.3，C177Y替代预计会产生不利的功能性后果。斜视的主要变异位点 rs75078292 和与 C177Y 相关的变异位点 rs6420484 也与一个插入缺失（indel）变异 rs397693108 具有极高的连锁不平衡（LD），该插入缺失同样被预测会产生功能性后果（CADD评分16.1）。rs397693108 插入缺失在TSPAN10的两个异构体的mRNA中引入了4个碱基对的缺失，导致编码区出现移码突变。对于第三个异构体，这一插入缺失预计会导致mRNA的无义介导降解（NMD）。C177Y 相关变异位点 rs6420484 和插入缺失变异 rs397693108 的风险等位基因具有相同的次要等位基因频率（MAF），鉴于它们的高连锁不平衡（r2 = 0.98），这意味着它们出现在同一单倍型上。与主要GWAS变异位点连锁不平衡的其他变异的CADD评分较低。
为了寻找导致移码突变/无义介导降解（NMD）变异 rs397693108 的功能效应的进一步证据，斜视发生的基因原因检测检查了由GTEx联盟分析的TSPAN10基因表达的组织样本。尽管与斜视发展潜在最相关的组织，如眼外肌、视网膜和视觉皮层，并不在GTEx联盟评估的53种组织之中，但基因表达的调控通常在不同组织类型之间是保守的，因此仍然可以提供重要信息。在小脑和人类小脑半球中，与斜视相关的风险等位基因与TSPAN10表达降低有很强的关联（p = 1.30E−10 和 p = 8.10E−12），这与通过NMD降解mRNA异构体一致。此外，还有证据表明其他两个基因存在顺式eQTL效应。在睾丸中，风险等位基因与磷酸二酯酶6G基因（PDE6G）表达降低相关联（p = 5.82E−06），而在甲状腺中，它与ADP核糖化因子类似GTP酶16（ARL16）mRNA水平的表达相关联（p = 2.10E−06）。在睾丸中，rs397693108是与PDE6G表达相关的第47位eSNP；然而，它的效应几乎比排名最高的变异（距离15 kb，rs11150804，p = 1.80E−41）低1.6倍。与PDE6G相似，编码ADP核糖化因子类似GTP酶16的ARL16基因位于NPLOC4和TSPAN10附近（见图4）。在甲状腺中，rs397693108是与ARL16表达相关的第232位eSNP，其效应比排名最高的变异（距离34.5 kb，rs7503637，p = 5.50E−96）低四倍以上。相比之下，rs397693108是小脑中TSPAN10 eQTL的第15高排名，其效应与排名最高的变异（rs9905786，p = 7.20E−122）相等。在小脑半球组织中，rs397693108是TSPAN10 eQTL的第63位排名。
结构变异（SVs）也被认为调控基因表达，包括在17q25.3位点，在该位点Chiang等（2017）发现了SVs和SNPs对TSPAN10基因表达的共同调控证据。因此，总结来说，强有力的证据表明，与斜视相关的致病变异在神经组织中作为TSPAN10的顺式eQTL发挥作用，而在某些其他组织中则对PDE6G和ARL16起作用。在这三个eGene中，证据表明TSPAN10是最可能的致病eGene。然而，由于基因表达可以高度特异于组织，需要进一步的功能研究来检验eQTL效应是否在该位点影响斜视发展的机制中起重要作用。
(责任编辑：佳学基因)
