【佳学基因检测】布格替尼(Brigatinib)靶向药物基因检测

靶向药物基因检测导读

NF2（2型神经纤维瘤病）是一种常染色体显性遗传综合征，由于NF2肿瘤抑制基因的突变引起，可能导致多发性神经鞘瘤和脑膜瘤。目前尚无FDA批准的治疗这类肿瘤的疗法，因其持续进展而使患者面临高发病率和死亡率。通过结合高通量筛选、临床前体内建模和大规模激酶组评估，肿瘤靶向药物基因检测确定了可行的药物靶点和有效的实验疗法，以治疗NF2相关的神经鞘瘤和脑膜瘤。这些努力确认了ALUNBRIG®（布加替尼），一种FDA批准的多种酪氨酸激酶抑制剂（包括ALK），在已确诊的NF2缺陷型异种移植脑膜瘤和自发性NF2神经鞘瘤的基因工程小鼠模型中有效抑制肿瘤生长。令人惊讶的是，脑膜瘤和神经鞘瘤细胞均不表达ALK。相反，靶向药物基因检测证明布加替尼抑制了多种酪氨酸激酶，包括EphA2、Fer和粘着斑激酶1（FAK1）。这些数据展示了从头无偏药物发现方法的强大潜力，并代表了治疗NF2相关恶性肿瘤的重要进展。

肿瘤靶向药物基因检测着眼点

NF2（2型神经纤维瘤病）是一种罕见的遗传性疾病，由于NF2基因的双等位基因缺失，导致神经嵴来源的肿瘤发展。NF2基因编码肿瘤抑制因子Merlin，其生化功能通过基因解码基因检测得以明确 。双侧前庭神经鞘瘤是NF2的典型表现，该疾病也经常与多发性脑膜瘤的发展相关联。据基因解码基因检测的大数据分析，约90%的散发性神经鞘瘤和60%的散发性脑膜瘤（人类最常见的颅内肿瘤）存在NF2失活。在测有基因解码基因检测的指导，目前尚无FDA批准的药物疗法可治疗这些常见且进展迅速的肿瘤。

在肿瘤的靶向药物基因检测分析中，肿瘤靶向药物基因检测采用了系统生物学方法：（1）利用高通量药物筛选，识别FDA批准或后期开发的化合物，这些化合物可对抗Merlin缺陷型神经鞘瘤和脑膜瘤细胞；（2）整合来自激酶组分析和转录组分析的数据，确定未来开发的优先目标；（3）利用基因工程小鼠模型和肿瘤异种移植模型，为通过体外药物筛选识别的一组化合物建立初步的临床前疗效数据，以便识别至少一种药物进行临床试验。通过这种方法，肿瘤靶向药物基因检测确定了对NF2相关神经鞘瘤和脑膜瘤治疗有积极影响的单一药物和组合药物。尤其重要的是，肿瘤靶向药物基因检测在体外和临床前动物模型中确认了FDA批准的多酪氨酸激酶抑制剂（TKI）布加替尼，作为Merlin缺陷型神经鞘瘤和脑膜瘤生长的有效抑制剂。有趣的是，缺乏Merlin的神经鞘瘤和脑膜瘤细胞不表达布加替尼的主要已知靶点ALK。相反，肿瘤靶向药物基因检测证明，这种化合物在机制上抑制了多种激酶，包括先前确认为NF2相关肿瘤中致癌蛋白的粘着斑激酶（FAK）。这些数据展示了一种有效的系统生物学方法，适用于罕见肿瘤的临床前治疗发现，并支持将布加替尼作为多TKI治疗方案推进到治疗NF2相关脑膜瘤和神经鞘瘤的临床试验中。

靶向药物基因检测发现的药物治疗是否有效？

ALK-IN-1及其衍生物布加替尼与MK-2206或达沙替尼显示出协同作用，分别抑制NF2缺陷型脑膜瘤和神经鞘瘤细胞的活力。

ALK-IN-1是FDA批准的ALK抑制剂布格替尼（AP26113, ALUNBRIG®）的化学类似物。尽管ALK-IN-1已不再处于临床开发阶段，靶向药物基因检测比较了布格替尼与ALK-IN-1在与MK-2206或达沙替尼联合使用时抑制NF2缺陷细胞活力的能力。布格替尼像ALK-IN-1一样，抑制了NF2缺陷的Syn5蛛网膜和Ben-Men-1脑膜瘤细胞，以及两种独立的NF2缺失原发性脑膜瘤细胞系（MN612和MN621）的生长。当MK-2206单独使用时，几乎没有生长抑制活性，但与布加替尼联合使用时，在Ben-Men-1细胞中显示出轻微的协同作用，以及在Syn5、MN612和MN621细胞中。

联合使用ALK-IN-1和达沙替尼降低了人类雪旺细胞系的细胞活力，对NF2缺陷（HS01）细胞更为敏感。作为单一药物，布格替尼抑制了小鼠Nf2-/-神经鞘瘤MS02和人类NF2缺陷型HS01雪旺细胞的生长。小鼠MS02细胞对布格替尼的抑制更为敏感，与人类HS01细胞相比。与广泛筛选中的ALK-IN-1类似，布格替尼与达沙替尼在降低HS01和MS02细胞活力方面表现出显著的协同作用。基于这些结果，布加替尼靶向药物基因检测进一步通过对治疗细胞的转录组分析以及对体内肿瘤生长的影响，评估了布加替尼单药治疗以及与MK-2206或达沙替尼联合治疗的效果。

靶向药物基因检测如何增加治疗的有效性？

在靶向药物基因检测中，个性化治疗行动小组采用了一种无偏见、系统化的方法，最终确认布加替尼作为治疗NF2相关神经鞘瘤和脑膜瘤的新型单药疗法。这项工作始于基于细胞的药物筛选，使用了MIPE 4.0肿瘤学集合中的约2000种化合物。类似于其他同源NF2/Nf2表达细胞，ALK-IN-1被确定为对NF2缺陷的Syn5蛛网膜和HS01神经鞘瘤细胞系具有强效选择性抑制作用的药物。由于ALK-IN-1最初是作为能抑制ALK的一系列结构类似物中的一部分生成的，个性化治疗行动小组选择不直接将其作为治疗方法。最终，这一系列分子的治疗开发倾向于另一种结构类似物AP26113，即布加替尼。个性化治疗行动小组证实，布加替尼在减缓NF2缺陷的神经鞘瘤和脑膜瘤细胞系生长方面表现出与ALK-IN-1相当的疗效。此外，当与MK-2206联合使用时，布加替尼在体外对脑膜瘤细胞的生长抑制表现出轻微的协同作用。

ALK-IN-1和达沙替尼联合治疗降低了人类SW01细胞系的细胞活力，而对NF2缺陷（HS01）细胞表现出更高的敏感性。作为单一药物，布加替尼抑制了小鼠Nf2-/-神经鞘瘤（MS02）和人类NF2缺陷型HS01神经鞘瘤细胞的活力。MS02细胞显示出比HS01细胞更高的对布加替尼抑制的敏感性。与广泛筛选中的ALK-IN-1类似，布加替尼和达沙替尼在减少HS01和MS02细胞活力方面显示出显著的协同作用。基于这些发现，个性化治疗行动小组通过分析治疗细胞的转录组和评估其在体内肿瘤生长上的影响，进一步评估了布加替尼作为单药治疗和与MK-2206联合治疗的效果。

个性化治疗行动小组的研究强调了在目标疾病模型中进行激酶组分析的重要性，有助于识别潜在的并未预料到的药物靶点。根据ALUNBRIG™提交给FDA的数据，个性化治疗行动小组了解到，尽管布加替尼对ALK的IC50约为1nM，但它也能有效抑制ROS1和FLT3等多种RTK，以及FER、FAK/PTK2和BRK/PTK6等多种非RTK，表现出了广泛的活性。这些结果支持了布加替尼作为治疗NF2相关神经鞘瘤和脑膜瘤的强大抗肿瘤活性。