佳学基因MassARRAY SNP基因型技术———正确的基因序列获取+基因解码!
佳学基因MassArray分型技术
MassARRAYSNP基因分型技术是由美国Agena Bioscience, Inc.开发的一种新型DNA序列获取技术。Agena Bioscience, Inc.原名为Sequenom Bioscience Division,位于美国圣地亚哥,与佳学基因创始人黄家学博士曾经工作过的诺华制药基因组学研究中心毗邻。2005年至2008年之间正是Sequnenom公司大力发发展的公司。黄家学博士和Squenom的科学家保持密切的沟通和探讨。并及时将其引入中国,开发了极具竞争争力的基因检测产品。
佳学基因MassArraySNP分型平台通过PCR扩增跨越SNP位点的DNA序列,然后应用单一延伸引物(extension primer)扩增PCR产物,确保延伸引物只延长一个碱基。延伸产物用飞行质谱(TOF, time of flight)进行分析,根据一个碱基的分子量差别对SNP进行分型,也可做SNP位点等位基因频率计算。MassARRAY SNP基因型分析可以进行多重SNP分型,即一个反应可同时分型多个SNP位点。该技术分析正确,在分析数十至上百个SNP时具有价格优势。
佳学基因MassArray技术的先进性
MassARRAY飞行质谱检测系统基本原理为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 技术。将制备好的样品与芯片基质共结晶,将该晶体放入质谱仪的真空管,而后用瞬时纳秒 (10-9s) 强激光激发,由于基质分子经辐射所吸收的能量,导致能量蓄积并迅速产热,从而使基质晶体升华,核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子,产生的离子多为单电荷离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能,进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率加以分离,在真空小管中飞行到达检测器,飞行时间与离子质量成正比。MALDI产生的离子用飞行时间(Time-of-Flight,TOF)检测器来检测,离子质量越小,飞行时间越短。理论上讲,只要飞行管长度足够,TOF 检测器可检测分子的质量数是没有上限的。
图1 飞行时间质谱检测物质分子量的原理
佳学基因MassArray技术的应用
MassARRAY SNP基因型分析在生物科学、医学、农业研究和应用等多个领域具有非常好的应用前景,为全世界的科学家们提供优质的解决方案,获得了瞩目的进展。以下是一些代表文献:
技术特点
- 高性价比:在所有的SNP分型方法中,价格低。
- 高正确性:采用先进的飞行质谱的分型技术,分析正确。
- 广泛性:超过2000篇SCI文章,包括Nature, Science等先进杂志。
- 高效性:两周即可提供完整的实验报告。
设备仪器
分型方法 | 设备仪器 |
MassARRAY | MassARRAY Genetic Analysis System |
图2 MassARRAY Genetic Analysis System平台示意图
样品类型
所有类型样品必须用冰袋寄至公司。冰块应足量,以确保样品寄至公司时,冰块未有效融化。
- a)组织样品(需提供≥100mg组织。)
- b)体外培养细胞(需提供≥106个细胞。)
- c)基因组DNA (需提供≥5μg 基因组DNA)
- d)全血(需提供≥2mL全血)
价格
SNP分型(或基因突变检测)的费用根据需要分型的SNP位点,数目以及样品数量的不同而制定。
提交数据
分型结果示例。以下是MassARRAYSNP基因分型飞行质谱分析图:
图3 MassARRAY-SNP基因分型飞行质谱部分分析图
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