【佳学基因检测】高通量基因检测实验的仪器配备

目录

1. 测序系统

MiSeq 测序系统

NextSeq 500 测序系统

1.3 HiSeq 2500 测序系统

2. 样品制备系统

2.1 超声破碎仪

2.2 NeoPrep 文库制备系统

2.3 自动化液体工作站

2.4 基因扩增仪

2.5 离心机

2.6 电泳系统

2.7 凝胶成像系统

2.8 全自动核算片段回收系统

2.9 纯水系统

2.10 制冰机

2.11 移液器

2.12 超低温冰箱 .

3. 样品定量及检测系统

3.1 核酸定量仪 

3.2 微量样品微孔板检测仪

3.3 生物分析仪 

3.4 荧光定量 PCR 仪

4．细胞分析及培养系统

4.1 微流式细胞分析仪

4.2 微流控细胞芯片实验室

5. 实验室其它常规设备

6. 生物信息分析专用服务器

佳学基因测序平台设备配置预算

1. 测序系统

1.1 MiSeq 测序系统——聚焦通量（内置簇生成、内置控制电脑一台） 综合速度、高质量数据和贼长的读长，MiSeq 系统是测序靶向 panel,  扩增子和小型基因组的理想平台。它是毛细管电泳应用的经济替代，可开展快速测序和变异检测，适合时间紧 迫的研究。

可以在 2 天内完成一个 2 x 300 bp 读长的双向测序实验，得到 15 Gb 的数据。

 

1.2 NextSeq 500 测序系统——灵活通量（内置簇生成）

NextSeq  500 系统带来了高通量测序的通量以及台式测序仪的简约——将外显子组、转 录组和全基因组测序转变为日常的研究工具。高质量数据和正确性以及通用、灵活的平台， 让您轻松地从一个应用转换到另一个。从样品到结果的简单流程让您可开展低、高通量的研 究，以支持各种规模的项目。

可以在 2 天时间内完成 120 Gb 的数据测序，读长 2 x 150 bp，片段数单端 400 M,  双端800 M.

 

1.3 HiSeq 2500 测序系统——生产通量

HiSeq 2500 系统提供了一种高性能且经济的测序解决方案，让您能够快速经济地开展大 规模的外显子组、转录组和全基因组测序项目。此系统可平行处理一或两个测序流动槽，并 提供灵活的运行模式，让您可调整数据通量，以支持各种应用和大范围的样品量。

HiSeq 2500 有两种运行模式：高通和快速模式。高通模式下可以在 6 天时间内生产 1000Gb 的数据，读长 2 x 125 bp,  片段数单端 20 亿，双端 40 亿；快速模式下 2 天生产 300 Gb的数据，读长 2 x 250 bp,  片段数单端 300 M，双端 600 M.

2.  样品制备系统

Diagenode Bioruptor 超声破碎仪

    为新一代测序 DNA  样本与染色质免疫共沉淀实 验样本前处理量身订做；

    可以同时处理将 12 个样品；

    可以控制 DNA 打碎成 100~1000 bp 的片段；

    非接触设计，避免样品污染；

    不需使用特殊耗材,     节省实验成本；

    超声参数设置灵活，实验重复性好，结果高效性高。

 

NeoPrep 文库制备系统

NeoPrep 系统是为 Illumina 的 NGS 测序仪家族 而打造的，让市场领先的 TruSeq 和 Nextera 文 库制备流程更加简单；

    NeoPrep         系统有效简化了文库制备：步骤明显减少，出错机会减少，重复性更高，且手工操作时间要少得多；

    NeoPrep 每次运行带来了 16 个测序即用的文库，起始样品量可低至 1 ng.

Tecan Freedom EVO 自动化液体工作站

    仪器规格：根据工作台面大小，Freedom     EVO

有 4 种规格可选；

    独特的机械手设计赋予超强的自动化操作能 力，可提供 5 种移液和操作机械臂，每台 Freedom EVO 贼多可选配 3 个机械臂；

    可整合各种功能模块，有效满足实验要求，为升级提供足够的空间与可能，如振 荡器模块，磁珠提取模块，真空提取模块，储板架，条形码阅读器以及整合酶标 仪、离心机、电转仪、PCR 仪、细胞培养箱等等；

可分别用于血浆分装、核酸提取、Pre-PCR、Post-PCR、Pooling.

2.4  基因扩增仪 推荐：Bio-Rad  

2.5  离心机

2.5.1  小型台式常温型/冷冻型离心机 推荐：Eppendorf 或 Thermo  

2.5.2  大型台式冷冻型离心机 推荐：Thermo Sorvall  

2.6  电泳系统

用于样本制备中的鉴定及回收，推荐：Bio-Rad 或六一

2.7  凝胶成像系统

用于样本制备中的鉴定及回收，推荐：Bio-Rad

2.8 Blue Pippin 全自动核酸片段回收系统

    操作简单、节省时间：每一轮分离实验只需

3~6 分钟手工操作；

    适用分离回收核酸片段范围：50 bp~50 Kb；

    重复性高，正确回收指定大小范围的核酸片段；

    每次可运行 1~5 个样品，单独的进样通道消除 了样品交叉污染；

    收集产物纯度高，50%~80％的回收效率。

 

2.9  纯水系统

推荐：Millipore  

制冰机

推荐：Thermo 或国产

移液器

单道和多道移液器，推荐：Eppendorf  

2.12  超低温冰箱 推荐：Thermo  

3.  样品定量及检测系统

Invitrogen Qubit 核酸定量仪

    定量过程少于 5 分钟；

    高灵敏度，能检测低至 1 μL 的样品。

 

Tecan Infinite 200 PRO NanoQuant 微量样品微孔板检测仪

    高速检测：同时检测 16 个样本，样本体积仅需 2  μL，可使用多通道移液器上样，检测过程仅需数秒；

    高灵敏：核酸样本检测浓度低至 1 ng /μL；

    高 灵 活 性 ： 可 检 测 标 准 6~384  孔 板 、 半 量 微 孔 板 、NanoQuant 板等多种板型；

    可升级：所有 Infinite 200 PRO 适用功能模块可供升级。

3.3 Agilent 2100  安捷伦 2100 生物分析仪

    用于对各种大小片段进行正确定量；

    样品消耗量低，贼低只需 50 pg 总 RNA 样品；

    快速获得结果：30 分钟可完成 11 或 12 个样品的自动化 分析；

    对片段大小的定量分析结果正确性高。

3.4  荧光定量 PCR 仪

用于检测 DNA 接头连接效率，推荐：Bio-Rad 或 Thermo 等

4.  细胞分析及培养系统

Merck-Millipore Guava easyCyte 微流式细胞分析仪

    微样本：10 uL 加样量即可实现常规流式应用， 为微量样本和稀有样本探寻全新的实验设计 思路；

    微体积：将双激光 6 色 8 参数的强大分析功 能隐匿在台式型紧凑机身中；

    微操作：快速稳定的自动化应用模块，结合功能强大，专业灵活且简便直观的操 作及分析软件，将专业和高效兼收并蓄在轻松深入的研究工作中。

    微学习：简单明了的操作流程，高效专业化分析的同时，大大降低用户对仪器操 作的学习掌握时间，让您将更多时间精力分配给研究本身；

    微负担：稳定的仪器状态，高效简便的保养维护程序以及宇航级超微废液生成量。

5 Merck-Millipore CellASIC 微流控细胞芯片实验室

    一款真正模拟生物体内微环境的细胞培养芯片，帮助还原真实的细胞生存环境；

    利用微流控技术正确调控实验进程，提供动态细胞培养环境，高度模拟体内自然 生存条件，实时长期监测细胞状态；

    可进行长期药物反应检测、模拟肿瘤组织低氧环境、 细胞周期研究、免疫组化、细胞转染等各种实验。

5.  实验室其它常规设备

酸度计、磁力搅拌器、超声波细胞粉碎机、电动匀浆器、电热恒温鼓风干燥箱、电热恒 温水槽、立式压力蒸汽灭菌锅、摇床、恒温培养箱、电子天平、电子分析天平、迷你离心机、 涡旋振荡器、恒温混匀仪、冻干机等。

6.  生物信息分析专用服务器

    集硬件、软件、数据库于一体的生物信息分析平台；

    包括 3 大功能模块：管理节点、计算节点及存储系统；模块间相互独立，可以按照需求进行灵活多样的模块组合；

    定期系统维护：定期检查系统运行状态，实施维护，高效稳定运行；

    软件、数据库定期更新，并根据需求个体化添加软件和数据库资源；

    提供操作系统使用培训和各种分析专题培训。 

7

 

序号

设备 人民币含税参考价（万元）

1.1 MiSeq 测序系统  120

 

1.2 NextSeq 500 测序系统 260

 

1.3 HiSeq 2500 测序系统 660

 

2.1 超声破碎仪 38

 

2.2 NeoPrep 文库制备系统 114

 

2.3 Tecan Freedom EVO 自动化液体工作站 152

 

2.4 基因扩增仪 6

 

2.5.1 小型台式常温型离心机 2

 

小型台式冷冻型离心机 4

 

2.5.2 大型台式冷冻型离心机 15

 

2.6 电泳系统* 4

 

2.7 凝胶成像系统 11

 

2.8 全自动核酸片段回收系统 28

 

2.9 纯水系统 15

 

2.10 制冰机 7

 

2.11 移液器* 8

 

2.12 超低温冰箱 10

 

3.1 Invitrogen Qubit 核酸定量仪 4

 

3.2 NanoQuant 微量样品微孔板检测仪 25

 

3.3 安捷伦 2100 生物分析仪 38

 

3.4 荧光定量 PCR 仪 38

 

4.1 Guava easyCyte 微流式细胞分析仪 70

 

4.2 CellASIC 微流控细胞芯片实验室 48

 

5 实验室其它常规设备 30-80

 

6 生物信息分析专用服务器

80

*电泳系统考虑了电泳电源及电泳槽；移液器为 5 个实验人员所需的单道和多道移液器；其它仪器为单

台参考价。

 

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