【佳学基因检测】哪里可以作单细胞RNA测序(scRNAseq)科研服务?
佳学基因科研合作导读:
在生物医学技术的发展过程中,高通量测序方法结合基因解码技术有效改变了整个生物学领域。采用RNA测序技术(RNA seq)给我们以非常详细地研究整个转录组的机会,产生了许多重要的发现,目前,它已经成为一个生物医学研究的常规方法。然而过去的RNA测序主要是将一个组织的细胞做为一个整体来进行的,获得的转录序列实际上是整个实验样本从数千到数百万个细胞的基因表达情况的总体呈现,这种方法可能抹除了一个群体内不同细胞生物学功能、及生物学过程的差异。为进一步细化基因解码过程,单细胞RNAseq测序技术结合基因解码分析成为一种克服这类问题的方法。通过分离单个细胞、获取单个细胞的转录本、在单细胞水平上制做单细胞测序文库,scRNA-seq可以以产前所未有的分辨率来评估细胞群体之间、细胞群体内部以及细胞总体之间的生物学的特性差异。佳学基因为这一过程的顺利高效进行,开发了单细胞测序实验方案及数据分析和展现流程。以帮助佳学基因科研合作伙伴在科研项目进行的各个阶段提前做好规划和设计。佳学基因也可以在不同阶段参与规划、设计和执行。
单细胞测序导读:
根据《人体基因信息测序技术大全》,“转录组”是指细胞、组织或生物体内全部转录本的总合。结合生物学、医学及临床诊断的需要。其全部含义应包括全部表达出来的基因序列及其对应的生理功能和组织状态。因此,一个优质的转录本测序不仅包括正确全面的获得转录本的序列,更主要的是将这种基因序列同已知及未知的生物学医学功能状态结合起来。目前,这实际上是由两个技术体系精密配合下才得以完成。即测序技术和基因解码技术。转录组包括蛋白质编码信使RNA(mRNA)以及核糖体功能的重要参与者,这里是指核糖体RNA(rRNA)、转移RNA(tRNA)和具有调节功能的非编码RNA。根据《人体基因序列与人体疾病表征》,这三者的功能是相互交织的。部分mRNA序列也行使着调节RNA的功能。2005年高通量测序技术的出现使得佳学基因及其合作研究机构可以在核苷酸水平上分析RNA,从而对转录组进行详细研究。
批量RNA测序(RNA seq)是采用匀浆组织对大群细胞中提取的RNA进行的。佳学基因采用这一技术可以分析基因的组织及时空特异性表达、肿瘤组织及发育过程中选择性剪接的存在、变异的发现和由基因组重排引起的嵌合基因融合的检测。然而,由于提取和研究的RNA代表“平均值”,在样本中存在的数千到数百万个单个细胞转录组中,细胞之间潜在的重大和生物学上重要的差异被忽视了。佳学基因单细胞转录本测序分析技术可以为合作者提供因为他人忽视而带来的创新发现。
2009年,在高通量测序开始改变生物学领域仅仅四年,单细胞RNA-seq(scRNA-seq)的方案就诞生了。但是那时,分析技术和样本制备技术还不够完善。由于,这项技术能够以前所未有的分辨率研究单个细胞的生物学特性。在先进次scRNA-seq研究中,就对10到100个细胞进行了分析和表征。从那时起,该方法逐渐得到完善和改进。成本降低了,吞吐量提高了,研究社区现在可以使用几个商业平台。研究人员目前能够为单个项目分析和排序多达数万个单个细胞的转录组。在这里,我们概述了目前使用的贼常见的scRNA-seq实验方案以及scRNA-seq数据分析的基础知识。佳学基因还提供了其生物应用以及与新兴scRNA-seq技术相关的一些有待解决的问题,为佳学基因的合作伙伴提供进一步贡献学术研究的机会。贼后,佳学基因为合作研究人员设计课题及研究计划提供可供模仿和优化的scRNA-seq实验实用指南。
(责任编辑:佳学基因)