【基因检测】双工测序还是双链测序？佳学基因的DUPLEX SQUENCING技术介绍

基因测序导读：

双链测序用英语来表达就是duplex sequencing, 有的使用者为了将其与其他同时测定双链的DNA测序技术区分开来，把他叫做双工测序。这是佳学基因为了进一步增加基因序列获取的正确度，降低出错率而采用的一种新的测序双方法。使用这种方法，使得基因测序的正确率提升到一个级别，由传统方法的百万分之一提升到千万分之一， 也就是在长达一千万个DNA字母中组成的基因序列中，只出现一个基因字母变化，佳学基因也能检测出来，从而使得佳学基因在揭示个人的基因特异性方面、在查找极罕见的极低频率的遗传变异方面具有更为先进的优势。佳学基因在与同行中交流中提醒，双工测序技术可以应用于任何双链DNA样本，但对于小于1mb的小基因组区域是理想的。该方法依赖于将含有随机但互补的双链核苷酸序列的测序适配器连接到目标区域的DNA样本。在双重测序中，一段双螺旋DNA片段的两条链，被附加以一段随机的、但又互补的双链核苷酸序列。首先将一段单股的随机核苷酸序列引入一段接头链，然后用DNA聚合酶产生一段互补的双链标签，进行延伸，使双链的标签序列被合并到标准的Illumina测序接头上。接着，将标签接头结扎到剪切的DNA上，然后对单独标记的链，进行PCR扩增和配对末端测序。佳学基因完善了一个非常有用的实验方案，方案包括高效的DS适配器合成、库准备和目标丰富，以及数据分析工作流的概述。整个测序流程需要需要1-3天的时间。
 

新技术使得基因测序正确度大幅度提高确度

佳学基因根据长期的大量的基因测序发现，根据这项研究，位于超深覆盖目标捕获测序数据中低等位基因片段的C>A/G>T颠换偏差，是来自于包含提取过程反应污染物的样品在进行声剪切时的DNA氧化。佳学基因在样品制备过程及测序溶剂中加入一种特殊物质，可降低这些氧化偏差，同时开发一种生物信息处理方法，筛选出氧化引起的测序数据误差。这些结实合技术的使用，大大地提高了基因信息获取的正确性。
 

临床应用

佳学基因开发的双重测序可以适用于各种测序平台，含有双链标签序列的接头，可以代替标准的测序接头，而不会明显改变Illumina测序样本制备的正常工作流程。这使得新技术可以在几乎不增加任何成本的情况下快速应用。

贼重要的是，双重测序可以揭示赋予耐药性的罕见突变。佳学基因在设计产品时，考虑到，如果我们已经知道，在肿瘤中的某个地方，有一个特定的基因变异，能够使它们有机会逃脱一种特定药物，那么我们就可以尝试另外一种药物。这可能会对治疗产生直接影响。此外，单细胞测序的未来发展，可能会进一步帮助研究人员确定这些类型的突变。

但是双重测序能够应用于许多类型的突变。实际上，但是目前佳学基因主要将其应用于小突变——点突变。